期刊简介
本刊由中华预防医学会，广东省寄生虫学会主办，中山大学中山医院寄生虫学研究所，第一军医大学热带医学研究所，广东省寄生虫病防治研究所承办，编委会由全国及香港知名的寄生虫学，病原生物学，分子生物学等十余位专家组成，发行全国内各高校，研究机构及卫生医疗部门及港澳、台湾、英美地区。本刊专业论文起点高，质量优，印刷精美。
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- 杂志名称：热带医学杂志
- 主管单位：广东省科学技术协会
- 主办单位：广东省寄生虫学会 中华预防医学会
- 国际刊号：1672-3619
- 国内刊号：44-1503/R
- 出版周期：月刊
期刊荣誉：Caj-cd规范获奖期刊期刊收录：国家图书馆馆藏, 知网收录(中), 万方收录(中), 上海图书馆馆藏, 维普收录(中), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), CA 化学文摘(美)
广西南丹县旋毛虫COX1基因和5S rRNA基因分析
欧阳颐；黎学铭；张鸿满；杨益超；王勇
关键词：旋毛虫, COX1, 5S rRNA基因, 系统发生树
摘要：目的 分析广西壮族自治区南丹县旋毛虫(Trichinella spiralis)COX1和5SrRNA基因特点,阐述该分离株的系统发生关系及基因变异规律.方法 PCR扩增南丹旋毛虫分离株COX1和5S rRNA基因片段并对扩增产物进行测序;应用Blast和Clustal X软件计算其碱基组成,分析该分离株与GenBank中相应序列的同源性及遗传距离,同时应用UPGMA方法分析聚类关系.结果 扩增后COX1基因片段长419 bp.5S rRNA基因片段长695 bp.南丹旋毛虫分离株与Trichinella spiralis(T.spiralis)的同源性高,分别为99.0%和99.1%,遗传距离小,分别为0.005和0.014.采用UPGMA法构建的2个系统发生树,南丹分离株和T.spiralis具有高度同源性,位于同一分枝,与无囊包旋毛虫(T.papuae和T.zimbabwensis)分枝较远,后者独成一枝,与T.spiralis相比,2个基因均存在变异,且变异位点均为4个,分别占相应基因序列的1.19%和0.57%.2个基因均富含A和T碱基,A+T含量分别占相应基因的61.8%和66.4%.COX1变异存在转换和颠换,但均发生在密码子第三位点.5SrRNA基因变异位点分散,但变异均为转换,无颠换.结论 南丹旋毛虫分离株与T.spiralis具有高度的亲缘关系,其COX1和5S rRNA基因的碱基组成、变异位点及变异类型均具有偏好现象.
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