期刊简介
本刊由中华预防医学会,广东省寄生虫学会主办,中山大学中山医院寄生虫学研究所,第一军医大学热带医学研究所,广东省寄生虫病防治研究所承办,编委会由全国及香港知名的寄生虫学,病原生物学,分子生物学等十余位专家组成,发行全国内各高校,研究机构及卫生医疗部门及港澳、台湾、英美地区。本刊专业论文起点高,质量优,印刷精美。
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- 杂志名称:热带医学杂志
- 主管单位:广东省科学技术协会
- 主办单位:广东省寄生虫学会 中华预防医学会
- 国际刊号:1672-3619
- 国内刊号:44-1503/R
- 出版周期:月刊
期刊荣誉:Caj-cd规范获奖期刊期刊收录:国家图书馆馆藏, 知网收录(中), 万方收录(中), 上海图书馆馆藏, 维普收录(中), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), CA 化学文摘(美)
人副流感病毒广州分离株ZYMgz01全基因组序列测定及分析
陈翊;曾华;钟家禹;林涛;朱冰;周荣
关键词:人副流感病毒, HN基因, 同源性, 基因组
摘要:目的 探讨广州地区副流感病毒的基因组结构和基因型.方法 参照GenBank副流感病毒(U51116)全基因组序列设计11对引物,覆盖副流感病毒基因组的全长.以副流感病毒cDNA为模板分段扩增病毒基因组的全长,各片段克隆到T载体上,并进行序列测定和分析.结果 人副流感病毒ZYMgz01株全基因组核酸序列为15 462 bp,提交到GenBank的序列号为EU326526,与3型副流感病毒保守基因同源性为94.0%,具有3型副流感病毒的结构特征.基因组序列同源性比较结果显示,ZHYMgz01株病毒与兰州的LZ22 (FJ455842)病毒株的同源性高,为99.1%;与美国突变病毒株(U51116)同源性为95.1%;与美国病毒株(Z11575)同源性为95.2%;与日本(AB012132)病毒株的同源性为94.8%,而与加拿大(EU424062)病毒株的同源性为94.8%.系统进化树显示ZHYMgz01病毒株与兰州的LZ22病毒株同属一个进化分支.结论 广州地区儿童呼吸道感染的副流感病毒ZHYMgz01全基因组为15 462 bp,与3型副流感病毒的同源性高,确定ZHYMgz01是3型副流感病毒.3型副流感病毒系统进化可能与地域差异有一定的关系.
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