期刊简介
本刊由中华预防医学会,广东省寄生虫学会主办,中山大学中山医院寄生虫学研究所,第一军医大学热带医学研究所,广东省寄生虫病防治研究所承办,编委会由全国及香港知名的寄生虫学,病原生物学,分子生物学等十余位专家组成,发行全国内各高校,研究机构及卫生医疗部门及港澳、台湾、英美地区。本刊专业论文起点高,质量优,印刷精美。
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- 杂志名称:热带医学杂志
- 主管单位:广东省科学技术协会
- 主办单位:广东省寄生虫学会 中华预防医学会
- 国际刊号:1672-3619
- 国内刊号:44-1503/R
- 出版周期:月刊
期刊荣誉:Caj-cd规范获奖期刊期刊收录:国家图书馆馆藏, 知网收录(中), 万方收录(中), 上海图书馆馆藏, 维普收录(中), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), CA 化学文摘(美)
斑节对虾抗菌肽Penaeidin基因的克隆及其序列分析
高安健;赵若聪;叶松;曾硕果;邬玉兰;刘志刚;王亚龙
关键词:斑节对虾, 抗菌肽, 克隆, 序列分析
摘要:目的 克隆斑节对虾Penaeidin抗菌肽基因,构建克隆载体,测序后进行序列分析.方法 从斑节对虾采集血淋巴后提取总RNA,经反转录得到eDNA,用特异性引物进行PCR扩增得到具有双酶切位点的重组Penaeidin目的基因片段.将其连接至PMD18-T载体,转化至Top10克隆菌进行克隆并测序,用生物信息学软件进行序列分析.结果 测序结果表明斑节对虾Penaeidin抗菌肽基因全长225 bp,编码74个氨基酸.将克隆所得的斑节对虾Penaeidin基因序列与NCBI数据库中的斑节对虾Penaeidin基因(FJ686016,AF475082)同源性为100%,与其它物种虾的Penaeidin基因同源性为48%~92%.分子进化树显示斑节对虾Penaeidin抗菌肽和印度对虾Penaeidin抗菌肽聚为一大枝,而圣保罗对虾、小褐美对虾、巴西美对虾、白滨对虾Penaeidin聚为一大枝,南方滨对虾Penaeidin则自成一枝.二级结构预测表明本次克隆得到的斑节对虾Penaeidin信号肽区为β折叠片,成熟肽主要为β折叠片和转角结构.成熟肽的N端和C端亲水性较强,N端为柔性区域.其中氨基酸序列30-40和60-70表现为潜在的T细胞抗原表位.结论 成功克隆出斑节对虾Penaeidin基因,对其序列的分析结果将为后续的蛋白表达、工业化生产和理论研究奠定前期基础.
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