期刊简介
本刊由中华预防医学会，广东省寄生虫学会主办，中山大学中山医院寄生虫学研究所，第一军医大学热带医学研究所，广东省寄生虫病防治研究所承办，编委会由全国及香港知名的寄生虫学，病原生物学，分子生物学等十余位专家组成，发行全国内各高校，研究机构及卫生医疗部门及港澳、台湾、英美地区。本刊专业论文起点高，质量优，印刷精美。
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- 杂志名称：热带医学杂志
- 主管单位：广东省科学技术协会
- 主办单位：广东省寄生虫学会 中华预防医学会
- 国际刊号：1672-3619
- 国内刊号：44-1503/R
- 出版周期：月刊
期刊荣誉：Caj-cd规范获奖期刊期刊收录：国家图书馆馆藏, 知网收录(中), 万方收录(中), 上海图书馆馆藏, 维普收录(中), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), CA 化学文摘(美)
16SrDNA序列分析在临床不常见细菌鉴定中的初步应用
宋金龙；林勇平；梁颖；罗娅莎；陈定强；刘忠民
关键词：16S rDNA, 管家基因, 不常见菌株, 序列分析
摘要：目的 建立细菌16S rDNA序列分析技术并探讨其在临床不常见细菌鉴定中的应用价值.方法 收集经全自动微生物分析系统鉴定其可靠率在99％及以上的常见细菌10株和常规方法难以鉴定或少见菌17株,通过PCR扩增16S rDNA v3-v4区基因片段并进行序列测定,序列与16SpathDB 2.0数据库上已知细菌的16S rDNA序列进行比对分析确定细菌种属.当v3-v4序列片段不能明确鉴定细菌时,结合16S rDNA长片段测序及管家基因dnaJ和rpoB的序列做进一步分析.结果 经16S rDNA v3-v4区序列分析,10株(100％)临床常见菌都能鉴定到种水平,其可靠性大于98.0％.17株不常见菌株中,10株(58.8％)细菌只与1种菌相似性大于98.0％,成功鉴定到单个种水平;6株(35.3％)细菌与不止1种菌的相似比大于98.0％;1株菌与已知菌相似性在96.0％～98.0％之间只能鉴定到属(棒状杆菌).进一步结合16S rDNA长片段及管家基因dnaJ和rpoB的序列分析,所有菌株均可鉴定到单个种水平.结论 结合16SrDNA和管家基因序列分析,可用于临床常见及不常见细菌的分子鉴定.
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