期刊简介
本刊由中华预防医学会，广东省寄生虫学会主办，中山大学中山医院寄生虫学研究所，第一军医大学热带医学研究所，广东省寄生虫病防治研究所承办，编委会由全国及香港知名的寄生虫学，病原生物学，分子生物学等十余位专家组成，发行全国内各高校，研究机构及卫生医疗部门及港澳、台湾、英美地区。本刊专业论文起点高，质量优，印刷精美。
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- 杂志名称：热带医学杂志
- 主管单位：广东省科学技术协会
- 主办单位：广东省寄生虫学会 中华预防医学会
- 国际刊号：1672-3619
- 国内刊号：44-1503/R
- 出版周期：月刊
期刊荣誉：Caj-cd规范获奖期刊期刊收录：国家图书馆馆藏, 知网收录(中), 万方收录(中), 上海图书馆馆藏, 维普收录(中), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), CA 化学文摘(美)
华支睾吸虫Rab家族蛋白结构及演化的生物信息学分析
贾飞飞；黎壮伟；郭音彤；余新炳
关键词：华支睾吸虫, Rab家族蛋白, 生物信息学
摘要：目的：鉴定华支睾吸虫基因组中Rab家族基因并进行分类。方法使用MEGA5中的Muscle模块对秀丽线虫Rab进行多序列比对，以该比对结果作为查询，对华支睾吸虫蛋白数据库进行PSI－Blast搜索，使用ClustalW模块获得华支睾吸虫Rab蛋白家族序列，并根据比对结果定义Rab功能域（RabF1～RabF5）。使用MEGA5软件的邻接法建立华支睾吸虫Rab GTPases之间的系统进化树。再使用邻接法构建多物种Rab同源蛋白序列系统进化关系树。结果用PSI－Blast搜索华支睾吸虫基因组数据库，获得54个同源基因。这54个可能的Rab家族蛋白中有21个蛋白与参考序列的同源性超过50％。这些蛋白的编码基因由多个内含子和外显子组成，且序列长短不一，读码方向也不同。不同的Rab蛋白聚类形成多个Rab蛋白亚型，与Rab家族具有多种Rab蛋白种类相一致。结论华支睾吸虫Rab蛋白家族进化具有保守性，蛋白的分化与物种的分化相一致。
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