期刊简介
本刊由中华预防医学会,广东省寄生虫学会主办,中山大学中山医院寄生虫学研究所,第一军医大学热带医学研究所,广东省寄生虫病防治研究所承办,编委会由全国及香港知名的寄生虫学,病原生物学,分子生物学等十余位专家组成,发行全国内各高校,研究机构及卫生医疗部门及港澳、台湾、英美地区。本刊专业论文起点高,质量优,印刷精美。
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- 杂志名称:热带医学杂志
- 主管单位:广东省科学技术协会
- 主办单位:广东省寄生虫学会 中华预防医学会
- 国际刊号:1672-3619
- 国内刊号:44-1503/R
- 出版周期:月刊
期刊荣誉:Caj-cd规范获奖期刊期刊收录:国家图书馆馆藏, 知网收录(中), 万方收录(中), 上海图书馆馆藏, 维普收录(中), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), CA 化学文摘(美)
1953-2016年基孔肯雅病毒的系统进化及蛋白质多样性分析
聂恩琼;郭小芹;张应涛;陆家海
关键词:基孔肯雅病毒, 同源计分比值, 变异
摘要:目的 对1953-2016年基孔肯雅病毒的主要流行株进行分子进化特征和氨基酸位点变异情况分析,为防控基孔肯雅病毒的流行提供理论依据.方法 在NCBI数据库检索1953-2016年基孔肯雅流行株,按照暴发情况筛选代表性毒株35株,使用ScanProsite软件对基孔肯雅病毒蛋白的功能区域进行预测,用ClustalX和Mega 6.06生物软件对于筛选的35株代表株的核苷酸和氨基酸序列进行分析,构建种系进化树并分析氨基酸变异情况析.结果 进化树显示35株基孔肯雅病毒对应其3个基因型分支为3簇,分别对应基孔肯雅病毒的3个基因型:东/中/南非型(19株)、亚洲型(13株)和西非型(3株),各蛋白同源计分比值均为0.96以上.E2关键抗原表位(共19个氨基酸)也有变异,其中19株东/中/南非型毒株序列有1处位点(H18Q)发生替换,西非型毒株未发生变化,13株亚洲型毒株也显示有1处位点(N5H)变化.结论 基孔肯雅病毒进化较为保守,但在其重要功能区域出现一些位点的突变,关注其进化情况对于基孔肯雅防控工作有积极意义.
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